En Chile,  el pingüino de Humboldt está restringido a la Corriente de Humboldt desde Arica a Corral. Es completamente acuático en todas sus rutinas de alimentación y sus alimentos son principalmente anchovetas, pejerreyes, sardinas, calamares y crustáceos. No se acerca a las playas, prefiere islotes y zonas escarpadas. Se reproduce durante todo el año, aunque la mayor frecuencia de postura de huevos ocurre durante la primavera. Sus nidos son ubicados en cuevas o bajo rocas en islas e islotes cercanos a la costa. Sus colonias de reproducción son altamente vulnerables.